Баг заключается в следующем: Если в сборке есть ресурсы, и вы обфусцируете эту сборку, то все пройдет гладко, но при работе программы при первом обращении к ресурсам программа вылетит. По этому при переименовании классов/переменных нужно в исключения занести ресурсы.
И тогда будет все ОК :)
P.S. Что-то сегодня вообще делать ничего не хочется :(